Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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