Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPC1Q16533 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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