Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKN1Q16512 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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