Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SSX1Q16384 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SSX1Q16384 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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