Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMA4Q16363 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA4Q16363 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA4Q16363 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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