Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS72Q15906 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
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