Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF13Q15543 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms