Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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SEC23BQ15437 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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SEC23BQ15437 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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SEC23BQ15437 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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SEC23BQ15437 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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SEC23BQ15437 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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SEC23BQ15437 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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SEC23BQ15437 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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SEC23BQ15437 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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