Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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