Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RYR3Q15413 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RYR3Q15413 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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