Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B3Q15393 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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