Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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