Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms