Protein–RNA interactions for Protein: Q14687

GSE1, Genetic suppressor element 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSE1Q14687 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSE1Q14687 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms