Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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