Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCARF1Q14162 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARF1Q14162 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
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