Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H3Q13889 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms