Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP1Q13829 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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