Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOFQ13790 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOFQ13790 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
APOFQ13790 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
APOFQ13790 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
APOFQ13790 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
APOFQ13790 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOFQ13790 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOFQ13790 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOFQ13790 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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