Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEUROD1Q13562 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEUROD1Q13562 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEUROD1Q13562 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
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