Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTM1Q13496 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms