Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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