Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF6Q13247 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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