Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME3Q13232 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME3Q13232 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME3Q13232 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME3Q13232 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME3Q13232 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME3Q13232 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME3Q13232 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME3Q13232 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME3Q13232 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME3Q13232 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms