Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC3Q13217 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC3Q13217 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms