Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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