Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAF2Q12933 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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