Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPTFQ12830 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BPTFQ12830 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BPTFQ12830 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BPTFQ12830 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
BPTFQ12830 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BPTFQ12830 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BPTFQ12830 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BPTFQ12830 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BPTFQ12830 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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