Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 PDR12YPL058C 4536 nt3.24□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YDR535CYDR535C 501 nt3.24□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 SPP382YLR424W 2127 nt3.24□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 TEM1YML064C 738 nt3.24□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 ICS2YBR157C 768 nt3.24□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 ERV15YBR210W 429 nt3.24□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 APC5YOR249C 2058 nt3.24□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 TPO5YKL174C 1857 nt3.24□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 SSL1YLR005W 1386 nt3.24□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 BEM4YPL161C 1902 nt3.23□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 DBP7YKR024C 2229 nt3.23□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YPR1YDR368W 939 nt3.23□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YLL037WYLL037W 381 nt3.23□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 RPL15AYLR029C 615 nt3.23□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 AAR2YBL074C 1068 nt3.23□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 EXO84YBR102C 2262 nt3.23□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 JSN1YJR091C 3276 nt3.23□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 CIK1YMR198W 1785 nt3.23□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 PRP31YGR091W 1485 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 ARO1YDR127W 4767 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 snR68snR68 136 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YDL050CYDL050C 372 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 IES6YEL044W 501 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 BRR6YGL247W 594 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 EFG1YGR271C-A 702 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 RPA12YJR063W 378 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 VMA5YKL080W 1179 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 TPT1YOL102C 693 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YOL114CYOL114C 609 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 RIB4YOL143C 510 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 VAS1YGR094W 3315 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 PSP1YDR505C 2526 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 EAP1YKL204W 1899 nt3.22□□□□□ -1.89
NFI1Q12216 DUF1YOL087C 3351 nt3.21□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 HBT1YDL223C 3141 nt3.21□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 POL2YNL262W 6669 nt3.21□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 XRN1YGL173C 4587 nt3.21□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 TDA10YGR205W 873 nt3.21□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 YLL047WYLL047W 384 nt3.21□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 YLR076CYLR076C 423 nt3.21□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 PLP2YOR281C 861 nt3.21□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 PBP2YBR233W 1242 nt3.21□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 SRB8YCR081W 4284 nt3.21□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 RRP5YMR229C 5190 nt3.21□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 FLO11YIR019C 4104 nt3.21□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 YDR131CYDR131C 1671 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 BMH2YDR099W 822 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 COX18YGR062C 951 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 NNT1YLR285W 786 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 RIF2YLR453C 1188 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 GAB1YLR459W 1185 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 RFC3YNL290W 1023 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 ATG34YOL083W 1239 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 RPA43YOR340C 981 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 BNA4YBL098W 1383 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 SLY41YOR307C 1362 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 CDC5YMR001C 2118 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 MUS81YDR386W 1899 nt3.2□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 YDL071CYDL071C 375 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 SNU23YDL098C 585 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 CWC2YDL209C 1020 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 RGI1YER067W 486 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 CPR7YJR032W 1182 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 HOT13YKL084W 351 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 ATG16YMR159C 453 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 DSC2YOL073C 969 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 YOR203WYOR203W 354 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 RIX1YHR197W 2292 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 SRP68YPL243W 1800 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 NUP60YAR002W 1620 nt3.19□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 ENT5YDR153C 1236 nt3.18□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt3.18□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 GLG2YJL137C 1143 nt3.18□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 ECM13YBL043W 774 nt3.18□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 GRX7YBR014C 612 nt3.18□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 PDC2YDR081C 2778 nt3.18□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 BNI4YNL233W 2679 nt3.18□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 KIN82YCR091W 2163 nt3.18□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 ARP9YMR033W 1404 nt3.18□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 RAD2YGR258C 3096 nt3.18□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 KRE2YDR483W 1329 nt3.18□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 MAK5YBR142W 2322 nt3.18□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 SMX2YFL017W-A 234 nt3.17□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 RPS0AYGR214W 759 nt3.17□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 FOL2YGR267C 732 nt3.17□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 BAG7YOR134W 1230 nt3.17□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 YPR203WYPR203W 309 nt3.17□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 PEX6YNL329C 3093 nt3.17□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 TDA1YMR291W 1761 nt3.17□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 YNR066CYNR066C 1311 nt3.17□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 SUP45YBR143C 1314 nt3.17□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 DIA2YOR080W 2199 nt3.17□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 YPS6YIR039C 1614 nt3.16□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.16□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 RTT105YER104W 627 nt3.16□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 RPL30YGL030W 318 nt3.16□□□□□ -1.9
NFI1Q12216 RPN8YOR261C 1017 nt3.16□□□□□ -1.9
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