Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 KAP104YBR017C 2757 nt2.96□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 SAP185YJL098W 3177 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 SPR28YDR218C 1272 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 COS4YFL062W 1140 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 SRS2YJL092W 3525 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 YJR039WYJR039W 3366 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 LAP2YNL045W 2016 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 SIP1YDR422C 2448 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 SKI3YPR189W 4299 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 IZH1YDR492W 951 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 REH1YLR387C 1299 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 GTR1YML121W 933 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 PCL7YIL050W 858 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 MLH1YMR167W 2310 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 YOR333CYOR333C 417 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 LAA1YJL207C 6045 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 YJL016WYJL016W 1686 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 MDV1YJL112W 2145 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 ZDS2YML109W 2829 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 VPH1YOR270C 2523 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 MGR3YMR115W 1506 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 SAS2YMR127C 1017 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 SPS18YNL204C 903 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 MRM1YOR201C 1239 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 ATP3YBR039W 936 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 KIN82YCR091W 2163 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 TCP1YDR212W 1680 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 YEL043WYEL043W 2871 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 TRM13YOL125W 1431 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 SET6YPL165C 1122 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 STT4YLR305C 5703 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 MSH3YCR092C 3057 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 FAF1YIL019W 1041 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 YJL147CYJL147C 1149 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 YDR131CYDR131C 1671 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 YLR365WYLR365W 333 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 DBP7YKR024C 2229 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 NDT80YHR124W 1884 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-BRQ12193 CAT8YMR280C 4302 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 MAK21YDR060W 3078 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 NUF2YOL069W 1356 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 YBR197CYBR197C 654 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 CUS1YMR240C 1311 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 YDR431WYDR431W 312 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 SAC3YDR159W 3906 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 SLH1YGR271W 5904 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 YJU2YKL095W 837 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 COA6YMR244C-A 315 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 SPS4YOR313C 1017 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 RPC40YPR110C 1008 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 SET1YHR119W 3243 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 MSH6YDR097C 3729 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 SNM1YDR478W 597 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 YGR126WYGR126W 693 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 BOS1YLR078C 735 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 YLR428CYLR428C 345 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 STU1YBL034C 4542 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 TFC1YBR123C 1950 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 TTI1YKL033W 3117 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 RCE1YMR274C 948 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 BCS1YDR375C 1371 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 CBP1YJL209W 1965 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 SAS4YDR181C 1446 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 ELO3YLR372W 1038 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 ADI1YMR009W 540 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 YOR238WYOR238W 912 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 MSN4YKL062W 1893 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 STH1YIL126W 4080 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 YCR013CYCR013C 648 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 ALY1YKR021W 2748 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 MDS3YGL197W 4464 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 DOT6YER088C 2013 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1B-BRQ12193 TDA3YHR009C 1572 nt2.84□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 BRR6YGL247W 594 nt2.84□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 VAM10YOR068C 345 nt2.84□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 TOF1YNL273W 3717 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 MIX14YDR031W 366 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 PET191YJR034W 327 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 YMR310CYMR310C 954 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 IBD2YNL164C 1056 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 snR37snR37 386 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 BSD2YBR290W 966 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 RGA1YOR127W 3024 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 MMS1YPR164W 4224 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 SMP1YBR182C 1359 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 ESC1YMR219W 4977 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 YLR326WYLR326W 723 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 PEX17YNL214W 600 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 IDH2YOR136W 1110 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 SEN54YPL083C 1404 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 YDR089WYDR089W 2610 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 MIH1YMR036C 1665 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 NFI1YOR156C 2181 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 STF2YGR008C 255 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 ALO1YML086C 1581 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1B-BRQ12193 SLD7YOR060C 774 nt2.81□□□□□ -1.96
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