Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 COBQ0105 1158 nt3.51□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 BRR6YGL247W 594 nt3.51□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 CDC8YJR057W 651 nt3.51□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.51□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 AAR2YBL074C 1068 nt3.51□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 IZH2YOL002C 954 nt3.51□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 HHF1YBR009C 312 nt3.51□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 HRD1YOL013C 1656 nt3.51□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 GPI10YGL142C 1851 nt3.51□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 ATP25YMR098C 1839 nt3.51□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 SLA1YBL007C 3735 nt3.5□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 VPS17YOR132W 1656 nt3.5□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 snR68snR68 136 nt3.5□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 ERP3YDL018C 678 nt3.5□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 UPF3YGR072W 1164 nt3.5□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt3.5□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YLR416CYLR416C 399 nt3.5□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 MCA1YOR197W 1299 nt3.5□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 RRP36YOR287C 903 nt3.5□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 PNG1YPL096W 1092 nt3.5□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 BEM4YPL161C 1902 nt3.5□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 VIP1YLR410W 3441 nt3.5□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 APE2YKL157W 2859 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 GWT1YJL091C 1473 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 PWP2YCR057C 2772 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 APC5YOR249C 2058 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 SMT3YDR510W 306 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 BTN2YGR142W 1233 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 GEP4YHR100C 558 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 DPH1YIL103W 1278 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 SOP4YJL192C 705 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 URA5YML106W 681 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 SAS5YOR213C 747 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 MGE1YOR232W 687 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 DPB3YBR278W 606 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 KAR4YCL055W 1008 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 ZDS2YML109W 2829 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YJL049WYJL049W 1353 nt3.49□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 GCN5YGR252W 1320 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YDL071CYDL071C 375 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 ARF1YDL192W 546 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 NGG1YDR176W 2109 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YDR526CYDR526C 471 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YGL074CYGL074C 327 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YGR039WYGR039W 312 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 GTR2YGR163W 1026 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 MBR1YKL093W 1020 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 ERG2YMR202W 669 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 TSR4YOL022C 1227 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YBR287WYBR287W 1284 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 ARG5,6YER069W 2592 nt3.48□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 TRS120YDR407C 3870 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 FKH2YNL068C 2589 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 SPT10YJL127C 1923 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 TRX3YCR083W 384 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YPD1YDL235C 504 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YDR271CYDR271C 372 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YFL012WYFL012W 447 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 RPL1BYGL135W 654 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 PAU13YHL046C 363 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 IME1YJR094C 1083 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 RNH203YLR154C 333 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 NDL1YLR254C 570 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 DGA1YOR245C 1257 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 RPL1AYPL220W 654 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 BYE1YKL005C 1785 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 RAD4YER162C 2265 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 MYO3YKL129C 3819 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 SYT1YPR095C 3681 nt3.47□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt3.46□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 CST9YLR394W 1449 nt3.46□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 FAD1YDL045C 921 nt3.46□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 TMA19YKL056C 504 nt3.46□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YNL276CYNL276C 396 nt3.46□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 SRL1YOR247W 633 nt3.46□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 FDH1YOR388C 1131 nt3.46□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 ATP20YPR020W 348 nt3.46□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YPR077CYPR077C 372 nt3.46□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 MRPS9YBR146W 837 nt3.46□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YBP2YGL060W 1926 nt3.46□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 ESA1YOR244W 1338 nt3.45□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 MSD1YPL104W 1977 nt3.45□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 PMT6YGR199W 2280 nt3.45□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 AAD3YCR107W 1092 nt3.45□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 snR83snR83 306 nt3.45□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 NKP1YDR383C 717 nt3.45□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YFH7YFR007W 1062 nt3.45□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YJL114WYJL114W 681 nt3.45□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 RPN13YLR421C 471 nt3.45□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 PEX11YOL147C 711 nt3.45□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YPR053CYPR053C 456 nt3.45□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 DER1YBR201W 636 nt3.45□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YDL176WYDL176W 2127 nt3.44□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 RRN6YBL014C 2685 nt3.44□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 ETP1YHL010C 1758 nt3.44□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 LIF1YGL090W 1266 nt3.44□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YGL152CYGL152C 678 nt3.44□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 MRPL9YGR220C 810 nt3.44□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 SGN1YIR001C 753 nt3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20 ms