Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBRQ0VD83 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms