Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIPPLY1Q0D2K3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms