Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 TAF2YCR042C 4224 nt2.35□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 DSE4YNR067C 3354 nt2.35□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 ISW1YBR245C 3390 nt2.35□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 YGR067CYGR067C 2415 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 MIP6YHR015W 1980 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 SIR3YLR442C 2937 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 GRX3YDR098C 858 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 YDR161WYDR161W 1164 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 CGR1YGL029W 363 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 AML1YGR001C 747 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 YGR293CYGR293C 462 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 ARC15YIL062C 465 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 YIL174WYIL174W 228 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 SYS1YJL004C 612 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 ATG27YJL178C 816 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 YLR402WYLR402W 192 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 NMA111YNL123W 2994 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 RSM19YNR037C 276 nt2.34□□□□□ -2.03
HRD1Q08109 IRA2YOL081W 9240 nt2.34□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 ESL2YKR096W 3588 nt2.33□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 AI2Q0055 2565 nt2.33□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 GTT1YIR038C 705 nt2.33□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 PFY1YOR122C 381 nt2.33□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 SRO9YCL037C 1305 nt2.33□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 KEL2YGR238C 2649 nt2.33□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 RIM13YMR154C 2184 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 MED1YPR070W 1701 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 RPL23BYER117W 414 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 TDA8YAL064C-A 381 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YLL037WYLL037W 381 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 RNH203YLR154C 333 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 INP1YMR204C 1263 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YBL077WYBL077W 432 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 PNT1YOR266W 1272 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 RPS11BYBR048W 471 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 VHR2YER064C 1518 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 DSF2YBR007C 2211 nt2.32□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YCK2YNL154C 1641 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 SAM37YMR060C 984 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 KTI11YBL071W-A 249 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YNL184CYNL184C 327 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 PIS1YPR113W 663 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 BMT2YBR141C 1014 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 RTT10YPL183C 3042 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 SMY2YBR172C 2223 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YCG1YDR325W 3108 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YEF3YLR249W 3135 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 PEX6YNL329C 3093 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 MNT3YIL014W 1893 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YKU80YMR106C 1890 nt2.31□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 RGR1YLR071C 3249 nt2.3□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 AIM11YER093C-A 414 nt2.3□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 ERP6YGL002W 651 nt2.3□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.3□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 RPL14BYHL001W 417 nt2.3□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 RPL15AYLR029C 615 nt2.3□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 RIM9YMR063W 720 nt2.3□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 ATP3YBR039W 936 nt2.3□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 RPO41YFL036W 4056 nt2.3□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 TMA64YDR117C 1698 nt2.29□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.29□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 HMF1YER057C 390 nt2.29□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 SPC3YLR066W 555 nt2.29□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.29□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 PMS1YNL082W 2622 nt2.29□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 TOP2YNL088W 4287 nt2.29□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 TOR1YJR066W 7413 nt2.28□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YDR340WYDR340W 303 nt2.28□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 THO1YER063W 657 nt2.28□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 BUR6YER159C 429 nt2.28□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YGR026WYGR026W 837 nt2.28□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 RPS22AYJL190C 393 nt2.28□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 ATG3YNR007C 933 nt2.28□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 TPO5YKL174C 1857 nt2.28□□□□□ -2.04
HRD1Q08109 YGL176CYGL176C 1665 nt2.28□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 AXL1YPR122W 3627 nt2.28□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 SEC26YDR238C 2922 nt2.28□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 SAK1YER129W 3429 nt2.27□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 SWR1YDR334W 4545 nt2.27□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 PBS2YJL128C 2007 nt2.27□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 SLI1YGR212W 1407 nt2.27□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 GCD10YNL062C 1437 nt2.27□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 CFD1YIL003W 882 nt2.27□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 SFH5YJL145W 885 nt2.27□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 YJR128WYJR128W 360 nt2.27□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 YNL203CYNL203C 612 nt2.27□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 MPD1YOR288C 957 nt2.27□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 POS5YPL188W 1245 nt2.27□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 PHO2YDL106C 1680 nt2.27□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 YKR078WYKR078W 1758 nt2.26□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.26□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 APC9YLR102C 798 nt2.26□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 PSY3YLR376C 729 nt2.26□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 YMR087WYMR087W 855 nt2.26□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 YMR310CYMR310C 954 nt2.26□□□□□ -2.05
HRD1Q08109 YOR314WYOR314W 330 nt2.26□□□□□ -2.05
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