Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN3Q08043 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN3Q08043 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN3Q08043 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN3Q08043 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN3Q08043 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN3Q08043 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN3Q08043 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN3Q08043 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms