Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP4Q07065 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms