Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD51Q06609 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms