Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPAQ06546 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms