Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC9Q06265 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EXOSC9Q06265 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms