Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEUP1Q05D60 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms