Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SP4Q02446 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP4Q02446 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP4Q02446 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP4Q02446 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SP4Q02446 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SP4Q02446 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms