Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN2Q02246 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms