Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIBQ01892 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms