Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFITM3Q01628 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM3Q01628 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms