Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms