Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms