Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUCB2P80303 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms