Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC5P78333 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC5P78333 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC5P78333 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC5P78333 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC5P78333 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC5P78333 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC5P78333 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC5P78333 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC5P78333 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC5P78333 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC5P78333 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC5P78333 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC5P78333 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC5P78333 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC5P78333 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC5P78333 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC5P78333 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC5P78333 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC5P78333 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC5P78333 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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