Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB1P62873 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB1P62873 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB1P62873 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB1P62873 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms