Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL23P62829 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL23P62829 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL23P62829 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL23P62829 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL23P62829 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL23P62829 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL23P62829 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL23P62829 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL23P62829 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL23P62829 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL23P62829 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL23P62829 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL23P62829 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL23P62829 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL23P62829 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL23P62829 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms